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煙草ABF轉(zhuǎn)錄因子基因克隆與生物信息研究獲進(jìn)展(圖)

2014年07月09日 來(lái)源:煙草在線云南煙葉信息網(wǎng)報(bào)道 作者:楊春江
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  煙草在線云南煙葉信息網(wǎng)報(bào)道  大量研究表明,AREB/ABF轉(zhuǎn)錄因子在提高植物抗?jié)B透脅迫能力、增強(qiáng)植物對(duì)逆境的適應(yīng)性等方面具有重要作用。煙草作為功能基因組學(xué)研究的重要模式植物,具有易培養(yǎng)、自花授粉、易遺傳轉(zhuǎn)化、表型明顯等優(yōu)點(diǎn),是基因功能研究的理想材料,而目前有關(guān)煙草ABF轉(zhuǎn)錄因子的研究尚為空白。

  為獲得煙草AREB/ABF(ABA響應(yīng)元件結(jié)合蛋白/ABRE結(jié)合因子)家族轉(zhuǎn)錄因子基因序列,進(jìn)一步提高煙草的抗?jié)B透脅迫能力,中國(guó)煙草總公司重大專項(xiàng)“煙草基因組編輯技術(shù)的建立與應(yīng)用”[110201301011A(JY-11A)]課題組重慶大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院等,通過(guò)同源比對(duì)和RT-PCR技術(shù),從煙草品種紅花大金元中克隆到煙草AREB/ABF家族轉(zhuǎn)錄因子NtABF1(GenBank登錄號(hào)為KF736849),NtABF2(GenBank登錄號(hào)為KF736850)基因編碼序列,并進(jìn)一步利用生物信息學(xué)分析軟件對(duì)這兩個(gè)轉(zhuǎn)錄因子的蛋白理化性質(zhì)、高級(jí)結(jié)構(gòu)和生物學(xué)功能進(jìn)行了預(yù)測(cè)。

  生物信息學(xué)分析結(jié)果表明,NtABF1和NtABF2均含有保守的BRLZ結(jié)構(gòu)域,不含跨膜區(qū)和信號(hào)肽,二者均定位于細(xì)胞核,且都含有Ser,Thr和Tyr激酶識(shí)別位點(diǎn),與其他物種中該家族成員的結(jié)構(gòu)特征一致(說(shuō)明NtABF1和NtABF2均為典型的bZip轉(zhuǎn)錄因子家族成員)。序列比對(duì)和進(jìn)化分析結(jié)果顯示,NtABF1與擬南芥AtAREB3親緣關(guān)系最近,序列同源性達(dá)54.49%;NtABF2與茄科植物番茄SlAREB1、馬鈴薯StABF1和StABF序列同源性分別為83.63%,83.52%和83.00%,二者與擬南芥及番茄、馬鈴薯ABF轉(zhuǎn)錄因子有類似的功能。進(jìn)一步可通過(guò)構(gòu)建NtABF1和NtABF2的植物過(guò)表達(dá)載體,轉(zhuǎn)化煙草植株,分析轉(zhuǎn)基因煙草的抗逆性,并結(jié)合凝膠阻滯實(shí)驗(yàn)(EMSA),驗(yàn)證其與ABRE元件的結(jié)合特異性,從而為深入研究NtABF1和NtABF2參與的逆境脅迫信號(hào)通路提供更多數(shù)據(jù)?!?/p>

  以上研究結(jié)果發(fā)表在《煙草科技》2014年第6期上。該項(xiàng)研究由重慶大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院與西南大學(xué)家蠶基因組生物學(xué)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室合作完成。

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