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普通煙草DREB轉(zhuǎn)錄因子的序列鑒定表達(dá)研究獲進(jìn)展

2017年03月09日 來源:云南煙葉信息網(wǎng) 作者:
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  煙草在線據(jù)云南煙葉信息網(wǎng)報(bào)道  DREB轉(zhuǎn)錄因子的AP2/ERF結(jié)構(gòu)域,對植物抗逆起關(guān)鍵作用?!捌胀煵軩REB轉(zhuǎn)錄因子的序列鑒定與表達(dá)分析”揭示,普通煙草基因組編碼68個(gè)DREB轉(zhuǎn)錄因子家族成員,大部分DREB家族基因在煙草中低量表達(dá),但在逆境脅迫下基因表達(dá)量上調(diào)。該成果2月28日發(fā)表在《中國煙草科學(xué)》2017年第1期上。

  該研究利用生物信息學(xué)分析手段,以擬南芥DREB家族成員序列為參照,在普通煙草(Nicotiana tabacum)基因組公共數(shù)據(jù)庫中鑒定出了68個(gè)DREB轉(zhuǎn)錄因子。對煙草DREB轉(zhuǎn)錄因子家族進(jìn)行了理化性質(zhì)、系統(tǒng)進(jìn)化、保守結(jié)構(gòu)域和表達(dá)分析。

  該研究表明,普通煙草基因組編碼68個(gè)DREB轉(zhuǎn)錄因子家族成員,氨基酸數(shù)目差異較大;系統(tǒng)發(fā)育分析表明,擬南芥和煙草的DREB轉(zhuǎn)錄因子共125個(gè)成員形成6個(gè)進(jìn)化分支,其中煙草比擬南芥缺少A6分支;結(jié)構(gòu)域分析表明,同一分支內(nèi)的DREB轉(zhuǎn)錄因子的保守結(jié)構(gòu)域以及motif具有高度的一致性;組織表達(dá)分析表明,大多數(shù)DREB家族基因在煙草中表達(dá)量較低,在衰老、干旱和病害脅迫下基因表達(dá)量較多。此研究將為煙草DREB轉(zhuǎn)錄因子的深入分析奠定了生物信息學(xué)基礎(chǔ)。

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